Szczególnie aktywna część cząsteczki, która jest odpowiedzialna za jej sposób reagowania w danej reakcji. Większość cząsteczek posiadających określoną grupę funkcyjną zachowuje się w ten sam sposób w tych samych reakcjach chemicznych, niezależnie od budowy ich pozostałej części. Stąd, znając ogólne zasady, według których reagują dane grupy funkcyjne, można łatwo przewidzieć zachowanie cząsteczek, które je posiadają. Przykłady grup funkcyjnych: grupa aldehydowa (−CHO); grupa halogenowa (−X); grupa fenylowa (−Ph); grupa hydroksylowa (−OH); grupa karboksylowa (−COOH); grupa aminowa (−NH2, −NHR, −NR2) itp.